11月12日，科技部、财政部、中编办联合组成验收专家组对国土资源部科技体制改革阶段性工作进行验收，一致认为，国土资源部科技体制改革取得很大进展，全面完成了科技体制改革阶段性任务。

    国土资源部所属中国地质科学院以此次改革为契机，加大了学科结构调整力度，将原有的87个学科方向调整为5个重要研究领域、25个重点研究领域和45个研究方向，形成了符合地质工作发展需求的学科布局；实行了全员聘用制和新进人员的人事代理制，建立相应的聘后考评制度，积极进行“三元结构”工资制的分配制度改革；完成了8个非营利机构组建的阶段任务和目标；积极推动5个开发类研究所走向市场，初步形成了7大核心技术体系和一批各具特色的优势产品。为深化改革，2001年以来，国土资源部共对非营利机构投入5.24亿元进行支持。

    科技体制改革使科研院所的经济实力、科技创新和为行业服务能力显著增强。2003年，地质科学院总收入4.47亿元，比1999年增长86.35%。1999年以来，该院承担各类科研项目1400多项，解决了一批经济和社会发展中重大的资源环境关键技术难题。 1999年至2004年，该院共获国家科技进步、国家自然科学、国土资源科学技术等各类成果奖40项。